Les mycobactéries sont les bactéries qui causent deux maladies particulièrement importantes en santé animale telles que la tuberculose et la paratuberculose. Dans le cas de la tuberculose, il existe des programmes officiels visant à éradiquer cette maladie chez les bovins et les caprins. Cependant, l'interaction entre la faune sauvage et le bétail peut compromettre le succès de ces programmes à la fois pour la transmission des mycobactéries causant la tuberculose et d'autres mycobactéries non tuberculeuses qui peuvent interférer avec le diagnostic de la tuberculose.
Dans une étude menée par NEIKER, récemment publiée dans la revue Animals, des caméras de photopiégeage ont été placées pendant un an dans 67 emplacements sur trois fermes du Pays Basque avec des antécédents de Mycobacterium bovis ou de mycobactéries non tuberculeuses, et les données vidéo obtenues ont été utilisées modéliser les visites de six espèces sauvages dans ces fermes. Au total, 1293 visites d'animaux sauvages ont été enregistrées, 85 % d'entre elles se produisant pendant la nuit et le renard étant l'espèce qui a visité les fermes le plus fréquemment. Les interactions directes étaient pratiquement anecdotiques (2 %) par rapport aux interactions indirectes (98 %). Il est également à noter que les pâturages d'élevage étaient le lieu le plus propice à l'interaction entre la faune et les vaches, mais d'après les résultats obtenus la transmission des mycobactéries se ferait principalement de manière indirecte. Les latrines à blaireaux pourraient représenter des points de rassemblement pour le blaireau, le sanglier et le renard et donc d'exposition aux mycobactéries entre ces trois espèces et le bétail.
D'après les informations épidémiologiques antérieures et les schémas d'interaction observés, les sangliers, les blaireaux, les renards et les petits rongeurs sont les espèces ou le groupe le plus fréquemment en contact avec les bovins et peuvent donc être les plus impliqués dans l'épidémiologie des mycobactérioses à l'interface entre la faune et le bétail fermes de cette région.